L'auteur de manga en difficulté Satoru Fujinuma est assailli par sa peur de s'exprimer. Cependant, il a une capacité surnaturelle d'être forcé de prévenir les morts et les catastrophes en étant renvoyé dans le temps avant que l'incident ne se produise, répétant le temps jusqu'à ce que l'accident soit évité. Un jour, il est impliqué dans un accident qui le fait passer pour un meurtrier. Désespéré de sauver la victime, il se renvoie dans le temps pour se retrouver en tant qu'écolier un mois avant que son camarade de classe Kayo Hinazuki ne disparaisse. Satoru se lance maintenant dans une nouvelle quête: sauver Kayo et résoudre le mystère derrière sa disparition.