L'ispettore Zenigata viene esonerato dall'incarico di catturare Lupin perchè non ne è ritenuto all'altezza. Viene assunta quindi una nuova ispettrice di nome Keith, intenzionata a catturarlo, non importa se vivo o morto. Il celebre ladro, infastidito da quest'insolita siuazione, vuole far tornare Zazà alle sue vecchie mansioni, approfittando di un nuovo caso riguardante il traffico di armi da parte di un'organizzazione chiamata Shot Shell. Con l'aiuto di Jigen, porta a termine il furto di un sottomarino russo per poi venderlo all'organizzazione. Per guidare il sottomarino occorre necessariamente una mano esperta, quindi chi meglio della sua stessa creatrice? Rapiscono così l'astrofisica russa, mente del progetto, e le fanno pilotare il sottomarino.