전국시대의 역사 개조를 막고 현대의 고담시로 돌아온 배트맨들.하지만 다음날 일본 열도가 사라지고 고담시 상공에 거대한 섬 '히노모토'가 나타난다.수많은 야쿠자들이 내려와 고담시를 습격하는 가운데, 시민을 보호해야 할 저스티스 리그도 사라졌다는 사실이 밝혀진다.상공에서 특별한 에너지 반응을 감지한 배트맨은 진상을 파악하기 위해 히노모토로 향한다.그곳에는 야쿠자가 야쿠자를 지배하는 궁극의 인의 없는 세계가 펼쳐져 있었고, 그 정점에 군림하는 것은 저스티스 리그의 멤버들과 외모도 능력도 똑 닮은 '야쿠자 리그'의 초인들이었으니...