Toen Fred een jaar oud was, kon hij lezen. Op de leeftijd van vier jaar schreef hij poezie. Nu zeven jaar oud, schildert hij de Madonna van Da Vinci, speelt hij concerten van Mozart op de piano en lost hij wiskundige vraagstukken op, als was hij Pythagoras zelf. Zijn artistieke en wetenschappelijke briljantie veroorzaakt bij Fred (Adam Hann-Byrd) een heftige emotionele reactie op de twee werelden om hem heen. De emotionele wereld van Dede (Jodie Foster) zijn toegewijde moeder en de intellectuele wereld van Fred's begeleidster (zelf wonderkind) Jane (Diana Wiest). Verward, maar vastberaden gaat Fred op zoek naar vriendjes, begrip en een eigen plek tussen moeder en mentor. Little Man Tate, met Harry Connick jr. en geregisseerd door Jodie Foster, is een hartverwarmende film over een kleine held, die ervoor vecht om ergens bij te horen.