Ouran Academy is een prestigieuze school waar de meeste studenten uit rijke families komen. Een van de weinige studenten met een bescheiden achtergrond is Haruhi Fujioka (Haruna Kawaguchi). Door onverwachte omstandigheden sluit Haruhi Fujioka zich aan bij de mannelijke 'gastclub', terwijl ze haar geslacht verborgen houdt. Er groeit vriendschap en liefde tussen Haruhi Fujioka en de mannelijke leden van de 'gastclub'.