Het gigantische monster Raiga keert terug, stijgt op in de haven van Atami en valt de stad aan. Een tweede kaiju, Ohga, voegt zich al snel bij de chaos, en de twee monsters botsen en vernietigen grote delen van de stad. Verdedigingstroepen lanceren twee nieuwe wapens, de gigantische tank Kamikaze en de boortank Gokumei, om de monsterinvasie frontaal het hoofd te bieden. Maar zullen de beesten, terwijl ze zich een weg banen naar Tokio, voldoende zijn om te voorkomen dat de monsters de stad verwoesten?