A história do filme começa quando Arata inadvertidamente toca “Hermes Apocrypha”, Grimoire de Lilith. De repente, ele é envolvido por uma luz branca brilhante e uma menina aparece diante dele. Ela se chama Lilim e trata tanto Arata e Lilith como seus pais. Ao mesmo tempo que ela aparece, algo muda no mundo. A Eternal Library proibida desperta. Na Biblioteca é selada a culminação final da Alquimia, o White Demon Lord. O Senhor demônio branco parte para eliminar Arata e a toda a Trinity Seven por usurpar a posição de Demon Lord. Eriçado com poder incalculável, o White Demon Lord ataca Arata e desencadeia uma crise de desespero na qual Arata e a Trinity Seven devem salvar o mundo nesta última batalha.