Efter ett atomkrig styrs världen av intelligenta apor. De leds av den sympatiske Caesar. Med hjälp av sin hustru Lisa, en orangutang och en människa styr Caesar över ett primitivt men fredligt samhälle. Oron stiger dock när man upptäcker att aggressiva, strålskadade människor bosatt sig i ruinerna av en närbelägen stad. Samtidigt som de fientliga människorna förbereder sig för en attack mot aporna startar de krigiska gorillorna ett uppror mot Caesar. För att rädda sin krigshärjade värld tvingas Caesar kämpa mot både fiender och allierade.