Scoob! avslöjar hur vännerna Scooby och Shaggy träffades, och hur de tillsammans med de unga detektiverna Fred, Velma och Daphne grundade det berömda Mystery Inc. Nu, med hundratals lösta fall och spännande äventyr bakom sig, står de inför sin största utmaning hittills: en hemlig plan för att släppa loss spökhunden Cerberus i världen. När de kämpar för att stoppa den globala ”hundpokalypsen” upptäcker gänget att Scooby har ett hemligt arv och ett episkt öde som är större än någon kunnat ana.