ในปี 1999 อุกกาบาตขนาดมหึมาได้พุ่งชนโลกพร้อมกับสิ่งมีชีวิตจากนอกโลกที่รู้จักกันในชื่อเวิร์ม สิ่งมีชีวิตเหล่านี้สวมรอยเป็นมนุษย์จริงและสังหารพวกเขา เพื่อต่อต้านภัยคุกคามใหม่นี้ ZECT จึงถูกก่อตั้งขึ้น ซึ่งต่อมาได้สร้างระบบ Masked Rider เพื่อต่อสู้กับเวิร์ม การต่อสู้กินเวลานานกว่าเจ็ดปี ทำให้ทรัพยากรของโลกหมดลงและกลายเป็นดินแดนรกร้างว่างเปล่า ในปัจจุบัน การแย่งชิงอำนาจใน ZECT ทำให้เกิดกลุ่มใหม่ที่เรียกว่า Neo-ZECT ขึ้น Souji Tendou ชายผู้ถือครอง Kabuto Zector ตัดสินใจขายพลังของเขาให้กับ ZECT หรือ Neo-Zect โดยไม่ทราบสาเหตุ