参与超级海上钻油台“尼加雅”救援行动之后两年，队长仙崎大辅（伊藤英明 饰）与后辈吉冈（佐藤隆太 饰），成功从1万3千名海上保安员中脱颖而出，入选只有36个名额、由各地精英组成的“特殊救难队”，开始执行最前线、最高难度的海难救援工作。然而，在任职期间，一宗史上最大型海难事故却突然发生！一架珍宝民航客机，突然因引擎着火，急速坠入水位极深的东京湾水域当中，全机乘客和机组人员生死未卜；而刚答应吉冈求婚、身为空中服务员的美香(仲里依纱 饰)，更不幸被困机上！救援行动分秒争，面对燃油泄漏、机体爆炸、乘客伤亡等多项突发性死亡危机，特殊救难队面临史上最艰难考验。一场拯救346条人命的限时救援行动，正式开始…！