O que une grandes amigos? Para Daphne, Velma, Fred, Salsicha e o cãozinho Scooby-Doo, é um mistério! Literalmente! Neste filme, os fãs são levados de volta no tempo, para quando os nossos quatro heróis eram adolescentes novatos no assunto - sempre acompanhados por um cão detetive - e tiveram o seu primeiro encontro profissional. Injustamente acusados de encenar uma brincadeira com fantasmas, os rapazes são suspensos da escola. Para limpar os seus nomes, eles unem-se para resolver um mistério sobrenatural... E embarcam numa aventura repleta de bom humor. Esta história revela as origens de alguns dos personagens mais queridos do universo da animação e mostra que a lealdade aos amigos não é apenas uma característica dos cães!